مرکز تحقیقات راهبردی حوزه علمیه مشکوه مرکزی است جهت راهبری و ساماندهی تحقیقات بنیادین و مبنایی که نیازهای فکری و علمی حرکت مشکوه را شناسایی و مرتفع میکند.

پروژه هایی که مورد تعریف و حمایت این مرکز واقع میشود پروژه هایی است که هر کدام قطعه ای از پازل مکتب فکری و علمی حوزه علمیه مشکوه را شکل میدهد.

این مرکز برنامه های خود را در سه گام طراحی کرده است:

برخی از این پروژه ها در قالب مقاله و برخی در قالب کتاب یا پروژه پژوهشی بلند مدت تعریف می‌شود.